一、注意选择药剂的剂型
选择的浸种灭菌药剂一定要溶于水，不能使用粉剂浸种，因为粉剂不溶于水，药剂会浮在水面或者下沉水底，导致种子沾药不均匀，从而到不到浸种灭菌的效果。
二、准确配制药液
浸种灭菌所用的药剂浓度不能根据种子重量计算，一般是按照药剂的有效成分含量计算。同时浸种灭菌药剂的浓度和浸种时间有关，浓度比较低的时候，可以稍微延长浸种时间，浓度高的时候则要缩短浸种时间，如果没有准确掌握好浓度，则容易发生药害，或者降低种子浸种灭菌效果。
三、充分搅拌
种子放入药液里后要充分搅拌均匀，以排除药液内的气泡，让种子和药液充分接触，提高浸种灭菌效果。
四、药液面要高出种子
在浸种的时候，药液面要高出种子16cm以上，以免种子吸水膨胀后液面，降低效果。
五、掌握好浸种时间
浸种时间过长会产生药害，而浸种时间过短则达不到消毒灭菌的目的，因此具体的浸种时间应该根据药品使用说明进行操作。
六、要注意浸过的种子是否需冲洗和晾晒
对药剂忍受力差的种子在浸泡药液后，应该按要求用清水冲洗，以免发生药害，没有具体说明的则不用，但不管冲不冲洗，都要在浸泡药液后摊开晾干。
